p6505_1CFC_A_predict

Publié le par Cobra


Le projet 6505 est pour les clients FAH "classiques". Il simule le domaine A de la calmoduline (PDB 1CFC), un domaine très étudié de la protéine globulaire.

Ce travail est une collaboration avec des chercheurs de l'UCSF pour explorer des voies de prédictions des structures quasi-natives des protéines à l'aide de méthodes locales de densité d'énergie libre.


Client : Classique
Nombre d'atomes : 16825
Preferred deadline : 14 jours
Final deadline : 21 jours
Points : 74
Serveur : http://171.64.65.62:8080

http://nsm03.casimages.com/img/2010/06/27//100627102650221006304976.jpg
Note de Cobra : Tout le monde sait que le calcium (Ca) est vital, tout au long de notre vie, pour la formation et la préservation de nos os et de nos dents. Mais l'on sait moins que le calcium joue également un rôle extrêmement important dans divers métabolismes essentiels : coagulation du sang, contraction musculaire, pression artérielle, etc. et l'on commence à entrevoir son implication dans le cancer du côlon et même la maladie d'Alzheimer... Pour que le calcium puisse être absorbé par l'organisme, il doit être "fixé", et c'est surtout la vitamine D qui assure ce rôle. Mais pour remplir certaines fonctions notées plus haut, il est nécessaire que le calcium se lie à certaines protéines (enzymes et hormones adéquates). Ce projet 6505 étudie un domaine de la calmoduline dont la fixation des atomes de calcium induit un changement de conformation. Le complexe calmoduline/calcium adopte alors une conformation activante et peut ainsi interagir avec ses protéines cibles pour en moduler l'activité.

L'Université de Californie, San Francisco (UCSF) est une des meilleures universités au monde. Elle se voue à la promotion de la santé grâce à la recherche biomédicale de pointe, à l'éducation d'un haut niveau universitaire dans les sciences de la vie et professions de santé, et à l'excellence dans les soins aux patients (centres médicaux)


Définitions et explications

- Calcium-Free Calmodulin est référencée 1CFC dans la PDB (Protein Data Bank)
- Protéine globulaire
- Protéines de liaison du calcium
- Calcium
- Calcium et cancer du côlon
- Calcium et maladie d'Alzheimer


Stanford - Texte original

"Project 6505 is for the "classic" FAH clients. This project simulates domain A of calmodulin (PDB 1CFC), a well-studied globular protein domain.

This work is a collaboration with researchers at UCSF to explore ways of refining near-native protein structures using local free energy density methods."

 

 

 

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